由于城镇污水处理厂处理的污水中含有大量的微生物，其中包含对人类有害的病原微生物，城镇污水处理厂一般采用消毒剂对有害的病原微生物进行处理,以满足《城镇污水处理厂污染物排放标准》（GB18918-2002）规定的污染物排放要求，保护环境和公众健康。 城镇污水处理厂在满足环境监管要求的前提下，可综合考虑来水特征、处理工艺、运行成本等因素确定选用何种消毒剂。我省目前并未限制城镇污水处理厂使用次氯酸钠进行消毒，但消毒之后的出水应严格执行国家及贵州省相关的污染物排放要求。